Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1552941	1553017	77	33 [0]	[0] 91	dsdC	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CACGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGCC  >  minE/1553018‑1553078 |                                                             cacGTTTCCCCTCGTGGGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:682280/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCGACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:891834/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACATACAACTGAATGcc  <  1:1705900/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2885772/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3177541/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:317213/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3170293/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3060789/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3027044/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3016638/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2995066/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2986166/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2903435/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2886749/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2583068/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2854819/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2575832/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2842061/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2773074/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2767853/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2730432/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2684819/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2674819/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2671838/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2619922/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:676544/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:991083/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:969906/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:879675/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:870068/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:865589/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:853689/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:836395/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:783435/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:706859/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:686948/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2503164/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:667112/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:618198/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:608956/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:570140/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:414486/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:387337/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:366499/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3265975/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:3196419/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1336411/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:165829/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1653212/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1652135/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1652114/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1560132/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:155115/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1510883/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1508210/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1479153/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1431407/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1401796/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1685809/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1300448/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1287648/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1220165/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1193684/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1169082/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1159872/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1153633/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1069934/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1053373/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1041029/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2108966/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1012715/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:250013/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:23995/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2363010/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2300444/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:226307/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2260232/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2213404/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2136308/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2575284/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2009662/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2003555/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1976661/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1970597/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1920093/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1856212/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1834311/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1816114/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1793684/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:1767474/61‑1 (MQ=255) cacGTTTCCCCTCGTGCGGTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGcc  <  1:2433810/61‑1 (MQ=255) |                                                             CACGTTTCCCCTCGTGCGTTAATTCCACTTTGCGATGGGAACGAACAAACAACTGAATGCC  >  minE/1553018‑1553078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑