Missing coverage evidence...
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ACTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCTTT  >  minE/1557156‑1557217 |                                                              aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGATCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:440725/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:212515/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:90652/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:867721/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:846500/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:769159/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:694130/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:692683/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:32471/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:3223101/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:3206345/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:285782/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:2844421/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:2759910/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:2649071/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:2420539/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1068751/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:208577/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1853697/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1801789/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1795240/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1702416/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1635831/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1618950/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1435954/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1411624/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1345738/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1331348/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:126759/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1251210/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:1217460/62‑1 (MQ=255) aCTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCttt  <  1:115398/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACTAACAGGGTCAGTCCTGGTAGATTCATTTTGACCGGTGAAGTCTCAGTTTCTCTTCCTTT  >  minE/1557156‑1557217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑