Missing coverage evidence...
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GACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCGG  >  minE/1568424‑1568485 |                                                              gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2451172/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:99200/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:92857/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:86013/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:773040/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:580909/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:371661/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:336305/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:3289635/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:3281618/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:3034939/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2951949/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:292236/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2739867/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:273237/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2561595/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1020135/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2077627/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2075551/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2073801/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:2014578/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1999918/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1984374/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1771022/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1671927/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1575227/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1563273/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1489343/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1444575/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1420233/62‑1 (MQ=255) gACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCgg  <  1:1264955/62‑1 (MQ=255) |                                                              GACAGCCCCGCAGCAACCAGGCTTAATCCAAAGACCGTTGCCGCAGCGTGGCTTAACAGCGG  >  minE/1568424‑1568485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑