Missing coverage evidence...
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TGCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAGTGGTGG  >  minE/1592125‑1592187  |                                                              tGCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGA‑TTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1508985/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:335426/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1071639/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2759731/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2831869/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2848658/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2864397/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2992108/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:3080066/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:3126094/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:3154278/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:316754/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:3285331/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2722403/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:397347/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:503555/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:504394/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:576698/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:685611/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:76033/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:839756/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:917417/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:927122/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2169762/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1275770/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1326407/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1486497/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1595201/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1720177/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1787157/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1830473/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1862829/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:1902006/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2028960/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2167382/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2550632/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2267893/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2338878/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:238083/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2386215/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2466956/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2469686/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2487089/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:250502/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCACAgtggtgg  <  1:2958956/62‑1 (MQ=255)  gCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCCCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAgtggtgg  <  1:2793763/62‑1 (MQ=255)  |                                                              TGCTGGAGACAAAATGAGTGATGCGCCCGCCGGTTTGCTGCCAGATTTCCGGCCCAGTGGTGG  >  minE/1592125‑1592187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑