Missing coverage evidence...
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TCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAG  >  minE/1593449‑1593497 |                                                 tCTGTCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2572396/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGTTCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:475692/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2498347/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:703019/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:3289921/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:3183592/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:3119577/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:3085206/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:307937/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:3019839/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2865595/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2851677/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2812739/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2562311/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1097207/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2463695/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2384636/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2249894/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2151948/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2149099/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2148212/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2073998/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:2039384/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1817141/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1557379/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1465665/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1442316/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1257893/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:1179605/49‑1 (MQ=255) tCTGGCCACCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAg  <  1:288945/49‑1 (MQ=255) |                                                 TCTGGCCGCCGGAAAGCTGCGCCGGATAACGATCCGCCAGATGGGCAAG  >  minE/1593449‑1593497

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑