Missing coverage evidence...
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TTGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAC  >  minE/1615342‑1615402 |                                                             ttGCAGAACGCTGGTTTGTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1157448/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTa                       >  1:1458923/1‑40 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCgg                  >  1:1195509/1‑45 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCaaa  >  1:179338/1‑60 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCaa   >  1:1315203/1‑60 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2760890/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:3177621/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:3026938/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2981714/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2933776/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:291356/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2875310/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:344506/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2731056/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2550262/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2536534/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2532668/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:3223181/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:3280831/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2329622/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:359118/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:426671/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:467704/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:499854/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:548218/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:641045/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:807000/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:857940/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:972013/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:189728/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1132776/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1164423/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1207312/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1323103/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1408644/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1508478/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:157859/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1602162/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1622818/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1768995/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:183735/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2532301/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1938303/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:194602/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2006435/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2028384/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2090698/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2186997/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2191550/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:225962/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:1115494/1‑61 (MQ=255) ttGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAc  >  1:2346478/1‑61 (MQ=255) |                                                             TTGCAGAACGCTGGTTTCTGACATCTCTGCCAGCGTGCTATCCGGGTTCGTCACCAGCAAC  >  minE/1615342‑1615402

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑