Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1646251 1646279 29 27 [0] [0] 72 gcvR DNA‑binding transcriptional repressor, regulatory protein accessory to GcvA

TTGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCGG  >  minE/1646280‑1646340
|                                                            
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2920885/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:364633/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3160070/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3106901/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3052437/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3046688/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3032014/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3028384/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:3022627/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:398066/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2909284/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2888801/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2878674/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2858042/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2824303/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2805310/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2759578/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2669862/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:744783/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:980977/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:959530/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:948193/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:918298/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:846679/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:799928/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:784747/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:751228/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2587600/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:686728/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:663638/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:597793/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:59425/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:568091/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:532337/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:523575/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:443818/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1422046/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1795065/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1732023/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1614439/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1614171/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1563297/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1478018/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1466292/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:144302/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1807801/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1419988/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:141782/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1348886/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1323884/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1265452/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:120661/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1191656/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1143015/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:211922/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2579782/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2326802/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2300667/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:228834/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2199458/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2149267/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2142838/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1042773/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:207617/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2024914/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:201937/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:197232/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1950178/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1945003/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1869406/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:1860667/61‑1 (MQ=255)
ttGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCAAGTTTATTATGCTGCTTTCCgg  <  1:2126665/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
TTGAAGACAGTCGCCTGGCGATGCTGGGAGAAGAGTTCACGTTTATTATGCTGCTTTCCGG  >  minE/1646280‑1646340

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: