Missing coverage evidence...
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ACTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAACCGC  >  minE/1667060‑1667121 |                                                              aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:215780/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:91062/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:575818/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:542756/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:427406/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:359106/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:3215231/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:3084143/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:3006309/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2787833/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2786102/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2534618/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2442030/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2435371/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2256049/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:22169/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1013911/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:2001882/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:197667/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1797997/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1795226/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1786044/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1544358/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1479110/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1443622/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1410067/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1211056/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1205892/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1145904/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1051554/62‑1 (MQ=255) aCTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGCTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAAccgc  <  1:1447513/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACTTTACACTCAAAGACGACACCGCCCAGGTACGCTGCGCGATGTTCCGCAACAGCAACCGC  >  minE/1667060‑1667121

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑