Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	138625	138634	10	12 [0]	[0] 43	htrE	predicted outer membrane usher protein

TTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCAA  >  minE/138635‑138695 |                                                             ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3065589/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2627485/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2672435/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2717922/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2734605/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2817265/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:292858/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3003614/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3011352/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3032442/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3063307/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2556040/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3071185/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:32127/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:3241449/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:401798/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:537384/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:727472/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:856401/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:858290/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:923483/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:990744/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1961912/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1099439/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1182357/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1258638/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1382814/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1558824/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1569660/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1667292/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1704310/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1090507/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1987315/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2016115/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:207906/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2108142/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2284095/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2357728/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2409265/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2417140/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:2441779/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTACGGTTCaa  <  1:1697558/61‑1 (MQ=255) ttAATACTGACCGTAACCTGATTTTTAATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCaa  <  1:1186183/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTAATACTGACCGTAACCTGATTTTTCATGCGTGAGTAATTACGCATGGATTTCGGTTCAA  >  minE/138635‑138695

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑