Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1677457	1677581	125	2 [0]	[0] 88	[ndk]	[ndk]

TGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAC  >  minE/1677582‑1677621 |                                        tGTACCAGCGTACGAGATTGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1895493/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCTGATTATAATGAGCAAc  <  1:1722211/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:273939/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3115957/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3098581/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3002262/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3001362/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2968549/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2912372/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2824128/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2781952/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:275494/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3137108/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2735542/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2675005/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2656911/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2633631/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2627934/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2626348/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2623092/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2594381/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2586162/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2573588/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:551821/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:989172/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:982161/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:950059/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:945211/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:927062/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:887172/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:830006/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:664634/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:62055/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:601134/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2380847/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:54299/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:440498/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:400979/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:365368/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3275225/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3249462/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3239148/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3210121/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3168752/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:3159060/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1357432/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1545536/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1529940/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1525592/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1519573/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1438232/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1427858/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1422840/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:140001/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1372441/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1363896/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1547409/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1323544/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1235131/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1233270/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1208490/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1182204/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1163813/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1153562/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1078912/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1078009/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1062993/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1950896/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1051065/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2209244/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2187373/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2177086/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2166863/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2131042/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2097442/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1995281/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1973112/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1953238/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:2569696/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:194043/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1840733/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1820262/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1782766/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1737725/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1673769/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:165667/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1608704/40‑1 (MQ=255) tGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAc  <  1:1593457/40‑1 (MQ=255) |                                        TGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAAC  >  minE/1677582‑1677621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑