Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1678551	1678602	52	32 [0]	[0] 91	pbpC	fused transglycosylase and transpeptidase

TCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTGC  >  minE/1678603‑1678664 |                                                              tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGTGGTATACGCTgc  <  1:2671875/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2995395/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:34848/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3292348/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3290806/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3231837/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3218793/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3210664/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3161759/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3143072/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3093192/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3089465/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3037536/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:375392/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2949198/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2851576/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2833056/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2811189/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2736378/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2700377/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2687745/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2674659/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2630740/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:684944/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:962502/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:957281/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:943107/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:935909/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:908399/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:906694/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:814570/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:801871/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:757761/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:724222/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:260630/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:682435/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:616604/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:577679/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:566623/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:550172/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:509225/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:494798/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:453031/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:417598/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:411912/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1642267/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2028378/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1951132/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:190896/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1807328/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1804809/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1792274/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1760839/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1721871/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1704157/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1646557/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:164274/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2054718/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1629969/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1573744/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1495101/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1322566/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1322404/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1310311/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:130141/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1273702/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:115060/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1027512/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2411426/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2586754/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:258221/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2580429/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2571130/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2553521/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2548004/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2536850/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2525000/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2486130/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:24443/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:1001033/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:237506/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:236085/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2358096/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2262853/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2251249/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2193297/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2135256/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2108984/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:2064523/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGGGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:255460/62‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTAGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTgc  <  1:3265148/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCGTCAGGCTGTAAGCGCAATTTGCCTGCCTTGCCGTGGCGAGCAAACGCGGTATACGCTGC  >  minE/1678603‑1678664

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑