Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1701690	1701709	20	4 [0]	[0] 34	hcaR/hcaE	DNA‑binding transcriptional regulator/3‑phenylpropionate dioxygenase, large (alpha) subunit

TAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGT  >  minE/1701710‑1701771 |                                                              tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:3190928/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2100876/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2293260/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2326274/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2514747/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2662549/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2691421/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:3095178/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:3127751/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:2007357/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:3192691/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:3281248/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:385115/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:587151/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:639811/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:741942/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:913525/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:162309/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1177665/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1242114/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1246989/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1300468/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1347483/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1433086/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1564164/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1589703/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1126002/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1648922/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1683792/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1688286/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1718909/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1742082/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1834347/62‑1 (MQ=255) tAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGt  <  1:1935489/62‑1 (MQ=255) |                                                              TAAAAAATATGACCACACCCTCAGATTTGAACATTTACCAACTGATTGACACCCAAAATGGT  >  minE/1701710‑1701771

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑