Missing coverage evidence...
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TGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAGG  >  minE/1714875‑1714936 |                                                              tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTGCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1345122/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2881232/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:217767/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2222240/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2337304/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2362632/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2371120/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2384815/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2621374/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2643401/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2707244/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2771173/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2829317/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2120965/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2882621/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:3031193/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:3041992/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:3182659/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:3202908/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:423890/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:654086/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:828086/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:984225/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1401680/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1067536/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1130365/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1163814/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1174166/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1204919/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1281980/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:135502/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1355116/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1384182/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1391436/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2160048/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1403084/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1489937/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1543488/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1602639/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1911730/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1934051/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2050886/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:2085754/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1059776/62‑1 (MQ=255) tGACGCGGCGGGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAgg  <  1:1407903/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGACGCGGCGTGGCGTTCCCGTTATAGACGCGGCTGGCGATTTCCAGCGCCGCCCGGTCAGG  >  minE/1714875‑1714936

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑