Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1736340 1736373 34 27 [0] [0] 136 rnc RNase III

Only 100 of 136 total aligned reads displayed.

CGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAAT  >  minE/1736374‑1736435
|                                                             
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCg                          >  1:1834535/1‑38 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCg                          >  1:2412345/1‑38 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:291041/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:332129/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:3294619/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:3218746/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:3170286/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:314699/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:3068170/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2984399/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2933989/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2920927/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:338301/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2862510/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2828720/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2816793/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2816271/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2794899/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2768222/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2749262/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2721932/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2700116/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:684990/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:944827/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:934612/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:903912/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:858263/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:836132/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:753904/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:745572/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:740639/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:71125/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:706570/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1035322/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:59222/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:552163/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:543356/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:500818/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:477795/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:470378/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:454794/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:440362/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:436441/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:392926/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1970589/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1394732/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1449801/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1451913/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:146059/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1567537/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1728190/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1236505/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1221136/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1185472/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1848378/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1924580/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1170626/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1964671/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2051774/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1131985/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2290957/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2588988/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2584708/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2519689/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1015029/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2321682/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2301332/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1073750/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1083606/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2252219/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2199746/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1117786/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAAtt                 >  1:2155170/1‑47 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACt             >  1:2075500/1‑51 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGCCGaa    >  1:2902614/1‑60 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:693244/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:124392/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:683961/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:827154/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:138232/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:957319/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:830340/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:484623/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:1584214/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:1626765/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:2513860/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:393167/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:1748015/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:2265591/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:3242391/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:582209/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:3235367/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:2008806/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:2985666/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAAt  >  1:1149923/1‑62 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTAGGCGAGAATTGACTCACGACGaaa   >  1:2145625/1‑61 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACAGTGTCGGCgag                     >  1:2820540/1‑43 (MQ=255)
cGAGGAATACGCCAACAATTAATGCTTCGACGGTGTCgtc                        >  1:396658/1‑38 (MQ=39)
cGAGGAATACGACACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:1781383/1‑40 (MQ=255)
cGAGGAATAAGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc                        >  1:2597762/1‑40 (MQ=255)
|                                                             
CGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAAT  >  minE/1736374‑1736435

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: