Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1749210	1749221	12	13 [0]	[0] 45	yfiD/ung	pyruvate formate lyase subunit/uracil‑DNA‑glycosylase

TCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCG  >  minE/1749222‑1749282 |                                                             tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATc             >  1:717762/1‑50 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTc   >  1:734361/1‑60 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTc   >  1:104862/1‑60 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTc   >  1:1490218/1‑60 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTc   >  1:2814682/1‑60 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:3147536/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2521674/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2595711/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:267282/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2693126/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:271981/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2742242/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2755046/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:305839/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:3087404/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2258254/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:3255282/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:3258565/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:369216/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:372137/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:544822/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:549583/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:633939/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:761270/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1715883/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1188937/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1265675/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1320804/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1411464/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1415709/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1425298/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1474873/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1530220/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1553108/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1562713/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:22717/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1965984/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1969641/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:1981967/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2004118/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2063430/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2074936/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2131839/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2204491/1‑61 (MQ=255) tcctcAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCg  >  1:2243436/1‑61 (MQ=255) |                                                             TCCTCAAACACCCTTGAATCTTTGATTTAAATCAATAAAAACCACACATCAAGTATGGTCG  >  minE/1749222‑1749282

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑