Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1771389	1771422	34	23 [0]	[0] 39	pheA	fused chorismate mutase P and prephenate dehydratase

CCCGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAT  >  minE/1771423‑1771484 |                                                              cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:3393/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2398424/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2422756/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2462648/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:247382/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2637643/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:302608/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:3047342/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:3077404/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:3154497/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:230812/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:442714/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:47599/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:528414/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:633123/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:769997/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:801731/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:94548/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:958291/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1450688/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1087429/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1220222/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1231932/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1234173/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1396719/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1430413/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1435122/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1444661/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1006764/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1900006/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1945086/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1986590/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2142452/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2162283/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2171133/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:222271/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:2300043/62‑1 (MQ=255) cccGATTCACGGTAATCAATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:479374/62‑1 (MQ=255) cccGATTAACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAt  <  1:1889926/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCCGATTCACGGTAATCCATGGGAAGAGATGTTCTATCTGGATATTCAGGCCAATCTTGAAT  >  minE/1771423‑1771484

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑