Missing coverage evidence...
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CCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTA  >  minE/1794134‑1794195 |                                                              ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGTCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:151190/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAGCGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:903776/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTTAACTATTa  <  1:1463023/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2700487/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2617894/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2748824/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2772503/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2809573/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2832927/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2928440/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2951568/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:3013578/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:3028861/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:3175211/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:3192728/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:436285/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:45483/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:537161/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:564174/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:755644/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:803960/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:961467/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:965799/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:977422/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:989019/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1622999/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1021860/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1098782/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:111851/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1164276/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:121970/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:12647/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1387013/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1484351/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:150025/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1507613/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1514329/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2656758/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1633978/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1751342/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1759517/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2185521/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2220071/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2395654/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2399616/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:2496222/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:253473/62‑1 (MQ=255) ccGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTa  <  1:1006470/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCGTACGTGGCGGTGTTACTCTCCACCGGCGCGGCATTCTTAACGGTGGTGGTGAACTATTA  >  minE/1794134‑1794195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑