Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1827386	1827404	19	20 [0]	[0] 29	mutS	methyl‑directed mismatch repair protein

ATTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGTGCTG  >  minE/1827405‑1827466 |                                                              aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctt  <  1:1499992/62‑2 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:2479234/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:989517/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:925065/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:857604/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:844261/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:740555/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:666878/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:666150/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:552632/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:485469/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:396980/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:3018852/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:2887746/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:2561685/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:109183/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:2117779/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:2079866/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1972149/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1957316/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:193922/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1858666/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:183237/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1746866/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1660576/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1655132/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1537676/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:1388857/62‑1 (MQ=255) aTTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTGTTGGCGGCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGtgctg  <  1:629096/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATTTGGGACCCGCGATCTGGTCGGTTTTGGCGTCGAGAACGCGCCGCGCGGACTTTGTGCTG  >  minE/1827405‑1827466

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑