Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1883220	1883250	31	18 [0]	[0] 33	rumA	23S rRNA (uracil‑5)‑methyltransferase

AGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAGG  >  minE/1883251‑1883312 |                                                              aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGGTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:708123/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:3245835/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2621791/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2801502/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2874817/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2927855/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2950082/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2972212/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:3224775/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:3228609/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2606278/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:338027/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:395022/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:705827/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:844780/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:878041/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:952776/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1080266/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:257496/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2531332/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:2071221/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1898523/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1865278/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1814437/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1772476/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1768599/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1716060/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1454504/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1434176/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1406817/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1395063/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:1321036/62‑1 (MQ=255) aGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAgg  <  1:118392/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGTCGCGCAATGGTATATCCTGCTTTTAATAACGCTTCGCTATCCCGAGCCAGCGTTGCAGG  >  minE/1883251‑1883312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑