Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1899321	1899333	13	55 [0]	[0] 39	recD	exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain

AAGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGA  >  minE/1899334‑1899395 |                                                              aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGccgccg           >  1:1828573/1‑53 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCcgccgc          >  1:38722/1‑54 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:452872/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:231900/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2423294/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2572474/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2647323/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2723980/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:3006707/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:3062885/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2205789/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:577912/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:604583/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:661279/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:680052/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:707671/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:755015/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:814670/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:861951/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:950236/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1728479/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1071409/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1117178/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:113482/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1167455/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:123412/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1361117/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1431322/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1631029/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1646137/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2221138/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1972357/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:1982964/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2038363/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2045316/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2097162/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:2133629/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGa  >  1:101148/1‑62 (MQ=255) aaGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCCAGGGTGa  >  1:2190600/1‑62 (MQ=255) |                                                              AAGCGGCAAACAAACGTGTCCCTCTCCGGCATCATGACTTAACAGTGCCGCCGCGAGGGTGA  >  minE/1899334‑1899395

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑