Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1917316	1917327	12	18 [0]	[0] 69	mutH	methyl‑directed mismatch repair protein

CTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCA  >  minE/1917328‑1917372 |                                             cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTTCTGGCCCGTCa  >  1:1285131/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGccc      >  1:3040956/1‑41 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGccc      >  1:2348996/1‑41 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGccc      >  1:1188256/1‑41 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTc   >  1:1051782/1‑44 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTc   >  1:525184/1‑44 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2435850/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2516857/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2535081/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2692616/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2706184/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2432751/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1076218/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2706287/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2728351/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2763654/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2770737/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2894200/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2979772/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2996589/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2390143/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:3237068/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:3275183/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:329287/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:367057/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:399644/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:431756/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:476402/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:483360/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:528314/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:547829/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:717880/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:737744/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:910114/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:918015/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:921388/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:987660/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1839618/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:107973/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1091794/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1094276/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1178713/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:120929/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1234414/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1270712/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1273392/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1383873/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1525682/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1530808/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1538961/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1564396/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1581854/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1637711/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2382643/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1870672/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1893494/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1894539/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1985886/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:1997297/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2018197/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2064126/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2071916/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2108420/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2134699/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2170490/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2224815/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2274202/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2290033/1‑45 (MQ=255) cTTTTATTCGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCa  >  1:2342590/1‑45 (MQ=255) |                                             CTTTTATTTGAAGAAGAATTTCACCAGTGCACTACTGGCCCGTCA  >  minE/1917328‑1917372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑