Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	1,472,849	T→C	Y145H (TAT→CAT)	nrdA →	ribonucleoside diphosphate reductase 1, alpha subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	1,472,849	0	T	C	100.0%	212.2 / NA	55	Y145H (TAT→CAT)	nrdA	ribonucleoside diphosphate reductase 1, alpha subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (24/31);  total (24/31)

TGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTTATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCAAA  >  minE/1472808‑1472878                                          |                              tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1168531/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:976824/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:933439/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:928036/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:852435/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:699379/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:615907/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:571036/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:438962/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:3130389/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2669924/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2661731/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2658791/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2621742/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2521209/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2279266/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1493117/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1599072/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1898975/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCGCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2204771/62‑1 (MQ=255) tGGACACCTTAATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1501361/62‑1 (MQ=255)  ggACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1180560/61‑1 (MQ=255)  ggACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2814505/61‑1 (MQ=255)   gACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:57528/60‑1 (MQ=255)   gACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:624031/60‑1 (MQ=255)   gACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:3003034/60‑1 (MQ=255)    acacCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:1407608/59‑1 (MQ=255)        cTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:723581/55‑1 (MQ=255)          ttATCTATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2344715/53‑1 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGAGCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:317402/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:1247195/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:1065773/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:997450/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:644778/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:860667/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:718260/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2163380/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:761365/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:797825/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:1318225/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:399711/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:1587950/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2997751/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:287267/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2801122/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:1812466/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2640002/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:1938314/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2506650/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2488419/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaaa  >  1:2367907/1‑62 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaa   >  1:1575664/1‑61 (MQ=255)          ttATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCaa   >  1:2094940/1‑61 (MQ=255)                 tCACGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2015062/46‑1 (MQ=255)                   aCGACCGTGATATGACCTTCTCTCATGCTGCCGTTAAGCAGCTg           <  1:2722312/44‑1 (MQ=255)                                          |                              TGGACACCTTTATCGATCACGACCGTGATATGACCTTCTCTTATGCTGCCGTTAAGCAGCTGGAAGGCAAA  >  minE/1472808‑1472878

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑