Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 2,708,337 C→T R294C (CGT→TGT)  trpS → tryptophanyl‑tRNA synthetase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,708,3370CT100.0% 261.1 / NA 78R294C (CGT→TGT) trpStryptophanyl‑tRNA synthetase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/78);  total (0/78)

CCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGCTATCACCGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGC  >  minE/2708296‑2708364
                                         |                           
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ccGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGcc         <  1:3092222/62‑1 (MQ=255)
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                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:412457/49‑1 (MQ=255)
                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:401378/49‑1 (MQ=255)
                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:3248343/49‑1 (MQ=255)
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                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:3126885/49‑1 (MQ=255)
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                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:3076601/49‑1 (MQ=255)
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                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:2932711/49‑1 (MQ=255)
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                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:625569/49‑1 (MQ=255)
                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:582846/49‑1 (MQ=255)
                    gaATTGCAGGAACGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:485195/49‑1 (MQ=255)
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                                cGCTATCACTGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:3083194/37‑1 (MQ=255)
                                  cTATCTCTGTGTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGc  <  1:560690/35‑1 (MQ=25)
                                         |                           
CCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGCTATCACCGTTTCCGCAACGATGAAGCCTTCCTGC  >  minE/2708296‑2708364

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: