Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	2,968,536	G→A	G160R (GGG→AGG)	yjjJ →	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	2,968,536	0	G	A	100.0%	79.7 / NA	24	G160R (GGG→AGG)	yjjJ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/24);  total (0/24)

AATATACTGGCGGTTGGTTGGTCGGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAATT  >  minE/2968513‑2968586                        |                                                   aaTATACTGGCGGTTGGTTGGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAacac              <  1:865340/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2744449/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:964105/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:958217/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:773914/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:632897/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:613445/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:56094/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:345894/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:3275185/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:3176973/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2829573/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2736135/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2728007/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2710303/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2687054/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:2677573/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:1275812/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:1266941/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:1260112/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:1235904/62‑1 (MQ=255)             gttggttgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:123214/62‑1 (MQ=255)             gttggtcgGTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAAtt  <  1:1809008/62‑1 (MQ=255)              ttggttggTCAGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGAGGAAAtt  <  1:107586/61‑1 (MQ=255)                        |                                                   AATATACTGGCGGTTGGTTGGTCGGGGAGGGGAATTATCAGCGATGGATTACTGCACAACACCCTGCGGAAATT  >  minE/2968513‑2968586

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑