Missing coverage evidence...
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GAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATC  >  minE/2931217‑2931276                                                            | gtgCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:78256/58‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACAGCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:1023138/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:979470/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:1006663/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:927399/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:92345/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:913089/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:90074/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:806053/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:804861/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:788549/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:754346/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:719840/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:684506/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:647907/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:613473/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:567152/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:409862/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:368757/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:304080/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:226987/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:148690/60‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATAGCCTTTCACATc  <  1:930783/60‑1 (MQ=255)  aGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATc  <  1:261255/59‑1 (MQ=255)                                                            | GAGCAGTTTTTCCGACACCGTTCCTGCCTGCGCGACGCCGGTCAGATCGCCTTTCACATC  >  minE/2931217‑2931276

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑