Missing coverage evidence...
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TTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAGG  >  minE/2935748‑2935809                                                              | ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCTgg  <  1:222519/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:895792/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:467538/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:496033/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:93376/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:516318/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:562197/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:575089/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:57787/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:614075/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:614590/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:626533/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:463316/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:665525/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:677191/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:882520/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:714572/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:734379/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:861166/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:812608/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:836620/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:341682/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:1003011/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:1002520/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:133715/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:954147/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:159407/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:174534/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:184621/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:256755/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:265057/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:463820/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:343485/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:370334/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:411768/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:415097/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:423656/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:950949/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:448748/62‑1 (MQ=255) ttttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:461719/62‑1 (MQ=255) ttgtCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:979643/59‑1 (MQ=255)  tttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:636800/61‑1 (MQ=255)  tttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:506443/61‑1 (MQ=255)  tttCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:149375/61‑1 (MQ=255)   ttCTTTCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:69990/60‑1 (MQ=255)                  acGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:743834/45‑1 (MQ=255)                  acGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:434477/45‑1 (MQ=255)                            gtgtTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAgg  <  1:1033743/35‑1 (MQ=255)                                                              | TTTTCTTGCCCGCAACAACGCAGGACTGTGTTTTCACTTGCATAAATTCCTCACTGGTCAGG  >  minE/2935748‑2935809

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑