Missing coverage evidence...
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AGCAGCTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGAAA  >  minE/2946895‑2946955                                                             | atcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:115719/59‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:52931/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:98676/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:924192/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:902322/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:876024/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:858618/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:805370/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:799486/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:675740/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:647896/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:625312/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:613098/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:572889/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:561731/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:556960/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:1007472/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:52212/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:49644/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:460314/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:432914/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:393454/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:361529/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:350188/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:346086/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:329227/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:20302/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:1021687/61‑1 (MQ=255) agcagcTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGaaa  <  1:1013700/61‑1 (MQ=255)                                                             | AGCAGCTCGTTGCAGATTGCCGCCGCCAGATGGTTTTTGCCGGTTCCTGGCTTACCAGAAA  >  minE/2946895‑2946955

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑