Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2978721	2978834	114	15 [0]	[0] 96	slt	lytic murein transglycosylase, soluble

AATTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATCAG  >  minE/2978659‑2978720                                                              | aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTTGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:116695/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:219023/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:385815/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:386765/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:392562/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:395549/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:54389/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:581229/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:598951/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:637543/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:663482/62‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGATCCGGAAACGAATATAAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:214267/62‑1 (MQ=255)  aTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:268851/61‑1 (MQ=255)  aTTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:882433/61‑1 (MQ=255)   ttGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATcag  <  1:935229/60‑1 (MQ=255)                                                              | AATTGCTGGATCCGGAAACGAATATCAACATTGGCACCAGTTACCTGCAATATGTTTATCAG  >  minE/2978659‑2978720

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑