Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 393921 394421 501 35 [0] [0] 15 [ahpC] [ahpC]

CAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGAAA  >  minE/393859‑393920
                                                             |
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGGATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:655456/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:429724/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:957453/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:883525/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:842969/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:795794/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:784227/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:735149/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:667943/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:605775/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:600612/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:594454/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:550185/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:455270/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:1006835/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:37319/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:368215/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:286666/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:1034134/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:285853/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:108354/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:23507/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:231440/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:182962/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:20780/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:201896/62‑1 (MQ=255)
cAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:19860/62‑1 (MQ=255)
 aaaaTTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:324911/61‑1 (MQ=255)
 aaaaTTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:168051/61‑1 (MQ=255)
 aaaaTTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:756576/61‑1 (MQ=255)
 aaaaTTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:593198/61‑1 (MQ=255)
 aaaaTTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:538007/61‑1 (MQ=255)
     ttAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGTATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:643488/57‑1 (MQ=255)
                       aGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:199387/39‑1 (MQ=255)
                          cATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGaaa  <  1:274835/36‑1 (MQ=255)
                                                             |
CAAAATTAAACCTTTTAAAAACCAGGCATTCAAAAACGGCGAATTCATCGAAATCACCGAAA  >  minE/393859‑393920

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: