Missing coverage evidence...
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TACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAC  >  minE/409466‑409526                                                             | tACTCTGCTGTTTGACCGTTACTGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:295970/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATGCCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:620587/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCAGTTTAc  >  1:154879/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:436069/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:435997/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:44738/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:481478/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:482659/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:497380/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:579928/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:601448/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:610900/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:634815/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:664486/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:688865/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:718567/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:872794/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:886992/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:942078/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:996114/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:188554/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:1025829/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:107083/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:113392/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:118161/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:1636/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:179956/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:181635/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:1010840/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:209781/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:210329/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:22019/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:244334/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:31861/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:320167/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:323701/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:333001/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:377723/1‑61 (MQ=255) tACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTCCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:727390/1‑61 (MQ=255) tACTCAGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAc  >  1:636958/1‑61 (MQ=255)                                                             | TACTCTGCTGTTTGACCGTTACGGAATACCGATGCGGTATCTTTCGCGATGCTCACTTTAC  >  minE/409466‑409526

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑