Missing coverage evidence...
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CTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCATT  >  minE/514046‑514107                                                              | ctgcGCCCTCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:595188/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCATAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:823416/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:858308/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:607830/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:610168/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:613750/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:623523/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:652738/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:657277/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:720114/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:766819/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:809585/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:838680/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:607341/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:86460/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:873219/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:88489/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:886181/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:890389/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:892281/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:903893/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:939946/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:945180/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:960840/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:980089/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:385572/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:1002274/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:1018037/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:1030003/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:17767/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:210626/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:254759/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:292506/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:309681/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:317049/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:31735/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:336041/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:1001493/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:386107/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:414170/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:424834/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:447194/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:474165/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:519648/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:537489/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:543616/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:54445/1‑62 (MQ=255) ctgcGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCAtt  >  1:54989/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCATT  >  minE/514046‑514107

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑