Missing coverage evidence...
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CGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACCGC  >  minE/556807‑556866                                                            | cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:455086/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:967891/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:814723/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:809133/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:804325/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:77074/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:749774/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:667527/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:534760/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:507143/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:1003870/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:454580/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:410994/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:384666/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:326529/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:317067/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:306665/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:246662/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:231300/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:197915/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:128420/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:1232/60‑1 (MQ=255) cGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCCGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:676950/60‑1 (MQ=255)  ggTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACcgc  <  1:58751/59‑1 (MQ=255)                                                            | CGGTAGTCAGGCGAGTTCCCGCCGGGAAAACAACCGCACCTGCAGAGATATCTTCACCGC  >  minE/556807‑556866

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑