Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	557397	557553	157	48 [0]	[0] 30	[iaaA]	[iaaA]

CCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATC  >  minE/557335‑557396                                                              | ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTTGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:212250/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:666199/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:397827/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:425274/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:496163/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:504002/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:554296/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:575841/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:584652/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:607234/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:612355/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:665563/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:1028258/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:669953/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:723032/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:749514/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:784302/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:796816/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:845734/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:861010/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:886650/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:913213/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:917846/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:974308/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:393455/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:1009141/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:1028800/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:1028854/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:1033983/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:114998/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:116133/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:118309/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:165619/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:186906/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:190938/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:201157/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:203294/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:224904/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:236115/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:236400/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:242323/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:249810/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:283857/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:295607/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:3408/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:344482/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATc  >  1:394300/1‑62 (MQ=255) ccACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCAAATCCATc  >  1:992192/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCACAGACTGTATGCCACCTCGGGCGTAGCGCTGGGTCCTGCCTTTACATGCCATATCCATC  >  minE/557335‑557396

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑