Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	575886	576497	612	56 [0]	[0] 53	[macA]	[macA]

TATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTT  >  minE/575824‑575885                                                              | tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTGAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:284048/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:572421/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:563034/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:587380/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:594585/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:61946/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:621921/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:630543/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:640146/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:66622/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:692420/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:709650/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:752490/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:782610/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:786554/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:793477/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:794390/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:801556/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:873072/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:893959/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:897247/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:909837/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:915102/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:921910/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:923560/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:946600/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:962308/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:986792/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:99684/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:311672/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:103215/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:122742/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:125139/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:140000/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:163344/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:179038/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:204606/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:211424/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:248931/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:251999/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:262518/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:270300/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:28096/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:1017870/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:313582/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:337859/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:337874/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:363350/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:437708/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:457798/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:467138/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:468341/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:50667/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:534240/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATAttt  >  1:562336/1‑62 (MQ=255) tATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTAGTTGATAttt  >  1:420020/1‑62 (MQ=255)                                                              | TATCTTAACCAAACATCAATAGTGTGATTACTAACGTAAATTTTAGGGTTTTGTTGATATTT  >  minE/575824‑575885

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑