Missing coverage evidence...
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CTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGT  >  minE/582955‑583015                                                             | cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:436704/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:992510/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:949324/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:927407/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:78071/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:658437/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:625567/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:604795/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:566489/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:544656/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:489828/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:130549/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:411856/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:406971/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:333816/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:318802/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:286837/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:196730/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:151501/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:132307/61‑1 (MQ=255) cTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGGCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:315295/61‑1 (MQ=255)  tCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:258620/60‑1 (MQ=255)  tCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGt  <  1:988207/60‑1 (MQ=255)                                                             | CTCAGGTCGTACGGGGTCAGTTCAACAGTCACTTTGTCGCCCGTCAGGATGCGGATGTAGT  >  minE/582955‑583015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑