Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	38755	38805	51	47 [0]	[0] 24	caiT	predicted transporter

GGATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAA  >  minE/38693‑38754                                                              | ggATCTGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:44373/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGTATCGGTGaa  <  1:487165/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAGTCGGTGaa  <  1:961894/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:710511/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:524906/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:537033/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:550506/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:587204/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:598840/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:617802/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:629153/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:635339/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:681084/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:510566/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:827093/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:864803/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:932969/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:945835/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:965640/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:972629/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:976538/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:9811/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:996550/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:504257/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:1027495/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:10589/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:113707/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:124837/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:163553/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:170589/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:172891/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:180390/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:255074/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:265726/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:310201/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:323003/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:32660/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:340885/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:34544/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:370131/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:42810/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:443915/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:46089/62‑1 (MQ=255) ggATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATAAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:792072/62‑1 (MQ=255)  gATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:689613/61‑1 (MQ=255)  gATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:988896/61‑1 (MQ=255)                        cgGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGaa  <  1:1014312/39‑1 (MQ=255)                                                              | GGATCGGTATAGAACAACATGCGCGGCAGATACATCAGCAACATCCCCACCGAATCGGTGAA  >  minE/38693‑38754

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑