Missing coverage evidence...
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GTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAC  >  minE/660393‑660454                                                              | gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAGGTGGTAc  <  1:767404/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:689027/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:557675/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:568353/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:569257/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:613036/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:65124/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:669392/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:672519/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:677150/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:681522/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:1012655/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:701057/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:703561/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:731830/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:733409/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:786406/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:898305/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:912009/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:917197/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:382161/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:14536/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:152607/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:173953/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:179776/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:236643/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:258111/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:301465/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:331911/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:122853/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:108837/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:1007668/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:442983/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:457623/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:474841/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:498212/62‑1 (MQ=255) gTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:508886/62‑1 (MQ=255)  tCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:52303/61‑1 (MQ=255)  tCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:924168/61‑1 (MQ=255)  tCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:395722/61‑1 (MQ=255)  tCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:620807/61‑1 (MQ=255)  tCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:586000/61‑1 (MQ=255)   cACCTTTTCAGGAACGCGCGACGGAGTGCTGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:119560/60‑1 (MQ=255)       ttttCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:925511/56‑1 (MQ=255)               aaCCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:897731/48‑1 (MQ=255)                   cccGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAc  <  1:340882/44‑1 (MQ=255)                                                              | GTCACCTTTTCAGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTAC  >  minE/660393‑660454

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑