Missing coverage evidence...
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TAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGT  >  minE/713326‑713386                                                             | tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTATCATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:713874/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:804904/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:592168/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:623037/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:63111/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:638530/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:711757/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:734699/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:758256/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:800005/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:585874/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:834655/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:836911/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:842206/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:907696/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:911244/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:917314/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:948688/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:952187/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:958799/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:469321/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:1038333/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:114969/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:126644/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:130762/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:136082/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:138560/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:163457/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:252908/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:378404/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:1013718/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:474152/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:495004/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:49503/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:496846/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:501480/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:509811/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:532511/1‑61 (MQ=255) tAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGt  >  1:532555/1‑61 (MQ=255)                                                             | TAAATTTCGCTGGTATATGGCACGACAGTTTTTAACATGTCGCCATCGCGGAGGTGAAGGT  >  minE/713326‑713386

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑