Missing coverage evidence...
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TACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATA  >  minE/715576‑715637                                                              | tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:139848/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:93820/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:917897/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:909346/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:854920/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:675524/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:655544/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:624700/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:616437/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:615202/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:582804/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:416953/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:415584/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:413774/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:411513/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:406825/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:387530/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:362328/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:36095/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:328390/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:319996/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:1030771/62‑1 (MQ=255) tACGGTGGAGAGTTTCCAAGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:663503/62‑1 (MQ=255)  aCGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACTCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATa  <  1:98071/61‑1 (MQ=255)                                                              | TACGGTGGAGAGTTTCCATGCTGGTAACAACCACGCATTGAACGCCGCACATAGCACAAATA  >  minE/715576‑715637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑