Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	48841	48972	132	67 [0]	[0] 27	[apaH]–[apaG]	[apaH],[apaG]

CGCGCGACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATG  >  minE/48779‑48840                                                              | cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:783004/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:630209/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:633054/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:633368/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:666922/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:667338/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:677288/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:679120/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:687779/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:71159/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:727228/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:751600/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:759096/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:763851/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:765014/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:78212/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:1023482/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:783543/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:791940/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:814140/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:85463/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:860380/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:875586/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:886287/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:892906/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:928125/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:932291/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:976447/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:98173/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:989933/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:992421/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:60679/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:1000465/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:131499/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:135822/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:1458/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:177473/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:179596/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:195596/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:215110/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:216883/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:267249/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:318842/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:320438/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:354672/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:399989/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:413748/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:619895/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:511083/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:510595/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:493877/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:48298/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:456822/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:445582/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:422391/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:418526/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:411044/62‑1 (MQ=255) cgcgcgACCAGATCGCCCGGCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:901510/62‑1 (MQ=255)  gcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:547074/61‑1 (MQ=255)  gcgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:56062/61‑1 (MQ=255)   cgcgACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:916604/60‑1 (MQ=255)       aCCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:792161/56‑1 (MQ=255)        ccAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:997429/55‑1 (MQ=255)                    tCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:833103/43‑1 (MQ=255)                     cAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:256075/42‑1 (MQ=255)                        ccAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:546160/39‑1 (MQ=255)                         cAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATg  <  1:60169/38‑1 (MQ=255)                                                              | CGCGCGACCAGATCGCCCGTCAGCCAGAGGGTATCTTTCCCAGGGGTAAATTCTACTTTATG  >  minE/48779‑48840

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑