Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 782603 782825 223 97 [0] [0] 27 [hlyE] [hlyE]

GCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTC  >  minE/782541‑782602
                                                             |
gCTCTATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:390624/62‑1 (MQ=255)
gCTCCTTCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCTACGATTTc  <  1:911944/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCTGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGAATTc  <  1:1026062/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:811909/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:1013776/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:809566/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:797180/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:796443/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:780448/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:779037/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:775180/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:766454/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:761512/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:744395/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:73590/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:728883/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:691619/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:680583/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:675100/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:674794/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:672518/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:669033/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:655394/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:642672/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:640617/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:89556/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:97960/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:97563/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:969558/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:966232/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:956581/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:94732/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:945802/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:938742/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:932279/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:930964/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:914151/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:821714/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:892122/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:886453/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:881548/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:879677/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:866837/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:856241/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:834420/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:827152/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:82588/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:825527/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:228598/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:326630/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:295300/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:294618/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:291870/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:260299/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:259783/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:248291/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:233747/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:230334/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:230239/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:618432/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:220708/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:195665/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:181721/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:178081/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:171586/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:157263/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:139368/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:121756/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:1036423/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:334960/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:629133/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:595830/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:594275/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:577463/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:5740/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:553865/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:545478/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:540656/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:500/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:497150/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:495641/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:331489/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:431483/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:430262/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:401945/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:372395/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:382576/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:379270/62‑1 (MQ=255)
gCTCCATCTGCGGATTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:84825/62‑1 (MQ=255)
 cTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:993408/61‑1 (MQ=255)
 cTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:127579/61‑1 (MQ=255)
  tCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:930955/60‑1 (MQ=255)
     aTCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:93289/57‑1 (MQ=255)
             tttCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:159244/49‑1 (MQ=255)
              ttCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:616018/48‑1 (MQ=255)
                         ttttAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:449980/37‑1 (MQ=255)
                           ttAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTc  <  1:245425/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCTCCATCTGCGGTTTCGATTGCGTTTTTAACTACTTCTACCGTTTTATCTGCAACGATTTC  >  minE/782541‑782602

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: