Missing coverage evidence...
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CTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGA  >  minE/856868‑856929                                                              | cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:891522/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:608953/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:613666/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:740078/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:762719/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:766574/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:795952/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:872298/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:886653/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:887227/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:1026716/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:93233/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:944078/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:945188/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:952692/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:955289/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:957769/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:964405/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:989017/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:34217/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:100433/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:10321/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:1037806/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:127297/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:143125/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:250132/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:282964/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:330518/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:569629/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:396859/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:432352/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:434183/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:48837/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:510927/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:519091/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:568372/62‑1 (MQ=255) cTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCAACGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:526232/62‑1 (MQ=255)  tttCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:910605/61‑1 (MQ=255)           cgcgGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:247096/52‑1 (MQ=255)               gAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGa  <  1:582038/48‑1 (MQ=255)                      tATGCACCGGGATCTCTTGCGCAACCATTAAGCGCATACGa  <  1:862118/41‑1 (MQ=37)                                                              | CTTTCAGCGTCGCGGAACCGCTATGCACCGGGATCACTTCCGCACCCATTAAGCGCATACGA  >  minE/856868‑856929

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑