Missing coverage evidence...
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CTCTAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACG  >  minE/861908‑861969                                                              | ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:51599/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:989894/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:912730/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:906345/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:827045/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:744479/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:735423/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:627036/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:60850/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:59947/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:1000779/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:50695/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:41156/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:303591/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:281676/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:17853/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:1656/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:121486/62‑1 (MQ=255) ctctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:120877/62‑1 (MQ=255)  tctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:601942/61‑1 (MQ=255)  tctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:383094/61‑1 (MQ=255)  tctAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACg  <  1:135924/61‑1 (MQ=255)                                                              | CTCTAATTTTGTTCAAAAAAAAGCCCGCTCATTAGGCGGGCTGGGTATCTGATTGCTTTACG  >  minE/861908‑861969

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑