Missing coverage evidence...
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GGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAG  >  minE/927436‑927492                                                         | gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:808082/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:6309/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:650848/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:654540/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:659474/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:700028/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:736896/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:769195/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:78444/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:621827/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:822346/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:833156/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:857257/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:867231/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:868800/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:872569/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:889702/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:958183/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:440998/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:1024636/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:203497/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:217215/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:237638/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:281712/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:376107/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:376276/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:429767/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:1020294/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:464095/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:512754/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:534496/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:577251/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:579604/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:593141/1‑57 (MQ=255) gggCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAg  >  1:608913/1‑57 (MQ=255)                                                         | GGGCAGGTCAGGGCGAGTGCGCGGGTAGTCGGTCTGTTGGATTTCCCAGGTCACCAG  >  minE/927436‑927492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑