Missing coverage evidence...
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ATGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCA  >  minE/942171‑942232                                                              | aTGACGCGTCAGGCGCGTGATTGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:5773/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:632455/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:99678/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:94897/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:93693/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:874529/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:867778/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:854376/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:8084/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:795896/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:752634/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:718234/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:708622/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:65857/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:643959/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:634264/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:103764/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:614487/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:567106/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:51744/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:488962/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:481755/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:399938/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:397093/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:33171/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:309239/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:273182/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:260935/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:243509/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:150319/1‑62 (MQ=255) aTGACGCGTCAGGCGCGTGAATGACTGATGCGATGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCa  >  1:724864/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCA  >  minE/942171‑942232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑