Missing coverage evidence...
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CACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGCCC  >  minE/952793‑952854                                                              | cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:773910/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:580596/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:586200/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:607728/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:615112/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:617458/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:658975/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:674549/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:70171/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:705934/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:708057/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:732190/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:518000/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:821064/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:840926/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:859980/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:88882/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:947203/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:961300/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:964387/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:975281/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:987291/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:994051/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:282427/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:1021662/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:1022985/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:10907/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:143599/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:15212/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:184183/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:21/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:230019/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:255657/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:259821/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:1021554/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:283189/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:289285/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:343639/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:385607/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:432996/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:437567/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:472454/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:478040/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGccc  >  1:499102/1‑62 (MQ=255) cACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATACGccc  >  1:373467/1‑62 (MQ=255)                                                              | CACTTTATAGAAGGCGATACCGATATACAGGCGGGTCCTGGTCGGTTTAACGACATCCGCCC  >  minE/952793‑952854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑