Missing coverage evidence...
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TGTGCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTCC  >  minE/960036‑960096                                                             | tgtgTCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:1741/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCCCGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:18285/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:870043/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:597515/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:604520/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:642861/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:789229/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:789578/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:815582/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:833417/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:85263/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:590222/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:873513/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:887263/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:899526/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:911338/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:988411/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:999160/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:326252/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:1006144/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:1017036/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:134678/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:199370/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:232344/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:256186/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:277204/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:349116/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:356689/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:390419/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:392778/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:398349/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:542005/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:565412/61‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCGCATTGTCTTCTTcc  <  1:1004947/61‑1 (MQ=255)                catATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:946625/46‑1 (MQ=255)                          aCAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTcc  <  1:819755/36‑1 (MQ=255)                                                             | TGTGCCGTTAAACATCATATGTTCTACAAAATGAGCCACGCCGAGCTCATTGTCTTCTTCC  >  minE/960036‑960096

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑