Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 71456 71525 70 52 [0] [0] 74 ilvI acetolactate synthase III, large subunit

AACCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGC  >  minE/71394‑71455
                                                             |
acccACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:736319/60‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:972921/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:813093/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:778408/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:656427/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:550636/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:540794/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:877979/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:88297/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:50888/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:491000/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:89296/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:408793/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:359601/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:356381/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:185033/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:211530/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:256281/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:295978/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:288048/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGATGAGAGCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:468224/62‑1 (MQ=255)
aaCCACTGAATGAGATCCGCGACTTGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:847744/62‑1 (MQ=255)
  ccACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:48116/60‑1 (MQ=255)
   cACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:174422/59‑1 (MQ=255)
     cTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:933429/57‑1 (MQ=255)
         aTGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:380388/53‑1 (MQ=255)
         aTGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:395986/53‑1 (MQ=255)
          tGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:305613/52‑1 (MQ=255)
          tGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:165069/52‑1 (MQ=255)
            agaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:457003/50‑1 (MQ=255)
            agaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:425891/50‑1 (MQ=255)
            agaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:613482/50‑1 (MQ=255)
            agaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:419886/50‑1 (MQ=255)
            agaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCACGCTCGTCAGTGc  <  1:61366/50‑1 (MQ=255)
             gaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:799496/49‑1 (MQ=255)
             gaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:558137/49‑1 (MQ=255)
             gaTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:636339/49‑1 (MQ=255)
              aTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTGAGTGc  <  1:621043/48‑1 (MQ=255)
              aTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:530345/48‑1 (MQ=255)
              aTCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:616436/48‑1 (MQ=255)
               tCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:446322/47‑1 (MQ=255)
               tCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:790677/47‑1 (MQ=255)
               tCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:738036/47‑1 (MQ=255)
               tCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:188070/47‑1 (MQ=255)
                ccGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:658894/46‑1 (MQ=255)
                 cgcgACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:514878/45‑1 (MQ=255)
                 cgcgACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:759535/45‑1 (MQ=255)
                 cgcgACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:417183/45‑1 (MQ=255)
                 cgcgACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:240774/45‑1 (MQ=255)
                  gcgACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:527600/44‑1 (MQ=255)
                   cgACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:1006570/43‑1 (MQ=255)
                    gACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGc  <  1:135510/42‑1 (MQ=255)
                                                             |
AACCACTGGATGAGATCCGCGACTGGTGGCAGCAAATTGAACAGTGGCGCGCTCGTCAGTGC  >  minE/71394‑71455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: