Missing coverage evidence...
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TATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGAT  >  minE/1011266‑1011325                                                            | tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:738438/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:539485/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:544135/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:580553/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:580991/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:581680/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:620490/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:688045/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:725805/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:725959/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:533073/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:745586/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:751478/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:75257/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:837293/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:868085/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:884579/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:904182/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:957963/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:995862/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:449635/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:134659/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:159664/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:16507/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:236476/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:243301/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:245531/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:250322/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:258402/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:390904/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:117425/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:47932/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:489134/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:489910/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:508624/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:51073/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:516790/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:532406/1‑60 (MQ=255) tATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCAAATCCCAGGCGTTGAATCGTGat  >  1:508592/1‑60 (MQ=255)                                                            | TATCGACTGGAGATGAGCGATAACCTGAGCGCCGCCGAATCCCAGGCGTTGAATCGTGAT  >  minE/1011266‑1011325

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑