Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1043452	1043990	539	62 [0]	[0] 27	[pdxY]–[tyrS]	[pdxY],[tyrS]

ACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTG  >  minE/1043390‑1043451                                                              | acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:666800/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:106948/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:505857/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:514375/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:548177/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:567267/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:567295/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:57385/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:597599/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:598851/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:60105/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:610055/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:615290/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:626080/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:643230/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:646170/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:504051/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:672937/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:701169/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:702293/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:743547/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:748597/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:754706/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:78669/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:813452/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:840542/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:847461/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:850812/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:868663/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:895735/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:9950/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:24794/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:107679/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:116492/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:125758/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:161791/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:163227/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:175186/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:187254/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:188434/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:197103/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:199758/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:214031/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:217059/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:225088/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:228285/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:503363/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:249921/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:253201/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:27269/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:305461/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:307475/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:308227/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:328575/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:341145/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:370429/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:377265/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:421520/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:464012/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:464558/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:464657/1‑62 (MQ=255) acaATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCAATTTGCCGTATTGGGtgtg  >  1:841837/1‑62 (MQ=255)                                                              | ACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTG  >  minE/1043390‑1043451

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑